Sci Rep:5-miRNA标签特征可作为食管鳞状细胞癌的结节病生物标志物

2021-11-29 06:16:33 来源:
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这项研究课题旨在确定一种可以预测食管鳞状巨噬细胞癌症(ESCC)患儿总体生存率(OS)的miRNAs标签。

从NCBI GEO获得119名ESCC患儿的miRNA暗示谱及其相应的医学信息,并将其作为训练集。在更早和晚期样本间筛选差异暗示的miRNAs(DEmiRNAs)。使用Cox回归深入研究、递归特征消除(RFE)-背书向量机(SVM)正则暗示式和LASSO Cox回归假设来识别病状性miRNAs,从而建立病状低分假设。此外,预测了这些病状性miRNAs的有盼望靶DNA,然后构筑了miRNA靶DNA网络。通过新功能硫化物深入研究,深入研究了ESCC中这些病状性miRNAs预测靶DNA的新功能涉及性。

在训练集中,更早与晚期样本有46个DEmiRNAs。建立了基于5个miRNAs的后果低分假设。该5-miRNA后果低分可以将训练集分为OS短时间显着各不相同的高危组和低危组。在一个来自癌症症DNA组图解(TCGA)的独立数据集中,出乎意料正确性了5-miRNA后果低分的后果分层能力。已确定了与这些miRNAs涉及的各种生物学过程和渠道,例如Wnt频谱渠道、TRP连接线的炎症介质可调渠道和雌激素频谱渠道。

这项研究课题提示,与病理分期涉及的5-miRNA标签对预测ESCC患儿的病状具有医学意义。

原始出处:

JunYu. Characterization of a five-microRNA signature as a prognostic biomarker foresophageal squamous cell carcinoma. Sci Rep. 27 December 2019.

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