Lancet Oncol:肾透明细胞癌与肥胖断言相关的转录组特征分析

2021-10-19 18:23:13 来源:
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一.数据归纳或多或少

高血压与肝半透明细胞会肺癌 (ccRCC)的安全性减小有关,但高血压又冲突地与该的病因改善有关,其潜在必要尚不明确。附属作者对高血压病症和短时在在增重病症在原发和肉瘤周饲料组成员织中所的甲状腺分解成和免疫酪氨酸组成员相异进行时数据归纳归纳。

本文参阅了基因序列请注意达引起的微环境的相异有助于解释高血压病症的生存优势(高血压直觉)。

二.归纳流程三.文章参阅1.COMPARZ路由请注意、TCGA-KIRC路由请注意、MSK免疫病患路由请注意数据集收集、矫正

在COMPARZ路由请注意的453名病症中所,有375名(83%)病症不具备可视的微阵列数据集,病患前BMI测量以及无十分困难和整体而言生存数据集进行时归纳(请注意1)。除119名(26%)超重病症外,来自COMPARZ试验的最终路由请注意仅限于256名(68%)病症(n=256)。

请注意1.COMPARZ临床试验路由请注意的人口统计博弈论和临床外观上

TCGA-KIRC路由请注意中所的332唯病症中所,审计了经肝结扎病患的152唯(46%)中期(即AJCC III和IV期)ccRCC病症的临床和人口统计博弈论数据集(请注意2)。在无关59名(39%)超重病症后,最后获得的路由请注意仅限于93名病症(n=93)。

请注意2.中期半透明细胞会肝细胞会肺癌TCGA-KIRC路由请注意的人口统计学和临床外观上

从62唯MSK周围饲料组成员织路由请注意中所进行时肝脏结扎的非转移性半透明细胞会RCC病症中所获得了细菌性和周围饲料样品。在这个路由请注意中所,从59名病症的PNN(肝周附近)周围饲料,25名病症的PNA(远离肝周)周围饲料以及55名病症的组成员织中所频域。在无关超重病症之后,最终路由请注意仅限于41名(69%)PNN抽取病症, PNA抽取为17(68%),抽取为37(67%)。从原本的203名参加者的MSK免疫病患数据归纳一些人中所无关74名(36%)超重病症后,总生存归纳的最终路由请注意仅限于129名(64%)参加者(请注意3)(n=129)。

请注意3. 采用MSK免疫病患的临床试验路由请注意的人口统计博弈论和临床外观上

2.高血压的肝半透明细胞会肺癌病症值得注意短时在在增重的肝半透明细胞会肺癌病症总生存期更长

根据KM生存归纳,在四组成员中所都发附属高血压病症的总生存期更长。在TCGA-KIRC路由请注意中所,经分期解析后,高血压病症的整体而言存活期少时短时在在增重新分配成员;在COMPARZ路由请注意中所,经IMDC安全性高分解析后,胖病症的整体而言存活期也少时短时在在增重新分配成员。在MSK免疫疗法路由请注意中所,经IMDC安全性高分解析后,BMI与患病率的无很大相异(如布1)。

布1.TCGA-KIRC路由请注意 (A)、COMPARZ 路由请注意(B)和MSK免疫病患路由请注意(C)的总生存期

3.COMPARZ路由请注意中所高血压病症不具备好处的PFS

对CPMPARZ路由请注意KM归纳后,KM斜率揭示,COMPARZ路由请注意中所高血压病症比短时在在增重病症不具备好处的PFS。

布S1.COMPARZ路由请注意中所高血压病症比短时在在增重病症不具备好处的PFS

4.可视中卫药物病患,高血压病症仍不具备好处的OS

KM斜率揭示了在可视中卫嘧啶还原酶类似物(pazopanib或Sunitinib)的两个病患组成员中所,高血压病症的OS即便如此较短时在在增重病症好。

布S2.COMPARZ路由请注意可视中卫药物病患组成员的总生存期归纳

5.COMPARZ路由请注意中所,高血压与短时在在增重的病症酪氨酸组成员基因序列外观上假定很大相异

好好完上述归纳,作者在三个路由请注意中所确认高血压直觉假定之后,接下来在COMPARZ路由请注意中所对高血压和短时在在增重病症审计了酪氨酸组成员学相异。先是好好了Hallmark基因序列集的GSEA归纳,比较高血压病症与短时在在增重病症彼此之在在的相异:高血压病症中所揭示窒息、TGF-β、上皮-在在充质转化和甲状腺分解成信号渠道很大上调,提示喉咙愈合必需的酪氨酸(布A)。布B是对布A筛选的几个基因序列请注意达渠道的Enrichment plots。

布S4.COMPARZ路由请注意中所高血压病症与短时在在增重病症的ccRCC酪氨酸组成员基因序列外观上假定很大相异

6.COMPARZ路由请注意与TCGA-KIRC路由请注意 中所高血压比短时在在增重病症的甲状腺分解成高分高

在GESA衍生的外观上基因序列集甲状腺分解成高分比较中所,高血压病症高于短时在在增重病症(如布2)。

布2.COMPARZ路由请注意(A)与TCGA-KIRC路由请注意 (B)中所高血压原发病症与短时在在增重病症的甲状腺分解成的z score

7.短时在在增重与高血压病症的肝细胞会为数众多无很大相异

对短时在在增重(7唯)与高血压(16唯)病症的原发的主要肝细胞会数量均采用流式细胞会术进行时审计。布A揭示了高血压病症与短时在在病症彼此之在在的肝细胞会为数众多的整体而言相异。布B明确揭示了高血压和短时在在增重病症T细胞会为数众多的浸润水平。发附属短时在在增重与高血压病症的肝细胞会为数众多无轻微相异,肝细胞会浸润的程度与BMI无关。

布S9.用流式细胞会术归纳短时在在增重与高血压病症的肝细胞会为数众多无轻微相异

8.与短时在在增重病症相比较,高血压病症肉瘤周饲料组成员织水肿减小,尤其是附近的肉瘤周饲料

在MSK的非转移性ccRCC病症的前瞻性路由请注意中所,作者并入了20个最很大的多样化的IPA规范渠道,这些渠道来自于高血压和短时在在增重病症的PNN和PNA抽取的比较(布A)。高血压和短时在在增重病症的PNN和PNA抽取彼此之在在的免疫浸润(ssGSEA高分)比较(布B)。

布S5.与短时在在增重的病症相比较,高血压病症的肝周饲料揭示出水肿和窒息减小

综上,在COMPARZ试验路由请注意中所,经过IMDC安全性高分调整后,发附属值得注意短时在在增重病症,嘧啶还原酶类似物病患提高了高血压病症的生存率,同样是拒绝接受sunitinib病患的病症。IMDC安全性高分数学方法包含的成分在在接反映寄生物因素对肺癌症持续性水肿依赖性(唯如贫血,中所性粒细胞会有所减小,和血小板有所减小症),这些因素有可能也是免疫病患结果和BMI彼此之在在关联必要的因素。发附属高血压病症的甲状腺分解成分数高于短时在在增重病症,与以后其他的数据归纳结果请注意明的,参加甲状腺分解成,β-氧化必需等等基因序列的富集的自然附属象一致。因此,甲状腺分解成的相异可以大多解释高血压病症拒绝接受嘧啶还原酶类似物病患后的很差病因。

此数据归纳为高血压直觉提供了生物学支持。在脑肺癌ccRCC的病症观察到高血压病症值得注意短时在在增重的病症微环境的相异:同样是高血压病症的的甲状腺分解成减小,但整体而言水肿无轻微相异。值得一提的是的是高血压病症的周围饲料揭示减小的水肿和窒息原因。半透明细胞会肺癌与肉瘤周饲料组成员织微环境的复杂相互依赖性有可能不具备临床意义,值得实质性数据归纳。

类似出处:

Sanchez A, Furberg H, Kuo F, Vuong L, Ged Y, Patil S, Ostrovnaya I, Petruzella S, Reising A, Patel P, Mano R, Coleman J, Russo P, Liu CH, Dannenberg AJ, Chan TA, Motzer R, Voss MH, Hakimi AA. Transcriptomic signatures related to the obesity paradox in patients with clear cell renal cell carcinoma: a cohort study.Lancet Oncol. 2020 Feb;21(2):283-293

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